导读 在Nucleic Acids Research上发表的一篇新论文中,由 Ludwig Oxford 的 Chunxiao Song 领导的一个团队报告了一种使用 TAPS(Tet 辅
在Nucleic Acids Research上发表的一篇新论文中,由 Ludwig Oxford 的 Chunxiao Song 领导的一个团队报告了一种使用 TAPS(Tet 辅助吡啶硼烷测序)进行全基因组长读长测序的方法,该方法是他和 Benjamin Schuster-Böckler 的小组2019年发表用于检测胞嘧啶甲基化和羟甲基化。
与其他 DNA 甲基化测序方法不同,TAPS 不依赖于会降解大量 DNA 样本的刺激性化学亚硫酸氢盐。这使得 Song 的小组能够将该方法应用于液体活检等应用。与此同时,长读长测序允许绘制重复和复杂的基因组区域,这可以揭示有关基因组的新信息。Song 和他的团队表明,全基因组长读长 TAPS 发现了许多在短读长 TAPS 数据中不存在的甲基化位点。该方法还能够检测印记基因中的等位基因特异性甲基化。
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