随着越来越多的癌症患者对其肿瘤进行基因组分析，以及更多针对基因组改变的疗法进入临床试验，将患者与他们有资格参加的试验联系起来的任务尤其具有挑战性。Dana-Farber Cancer Institute 开发的计算机平台使匹配过程变得更容易和更快，其设计师在一项新研究中报告说。
该平台名为 MatchMiner，可帮助临床医生和临床研究人员根据患者肿瘤的基因改变找到患者和靶向治疗试验之间的潜在匹配。在 Dana-Farber 的五年期间，它帮助获得了大约五分之一的同意加入 MatchMiner 中具有基因组数据的患者的精准医学试验。发表在npj Precision Oncology上的该研究的作者发现，它还将患者纳入此类试验的过程加快了 20% 以上。
“对患者肿瘤进行基因组改变分析已成为癌症治疗的一个广泛部分，特别是当针对这些改变的新药进入临床试验或被批准为癌症治疗方法时，”该研究的共同主要作者 Tali Mazor 博士说。与 Dana-Farber 的同事 Harry Klein 博士共同撰写的论文。“不断增长的基因组数据和越来越多的精准医学试验相结合，造成了一种脱节：为每位患者找到合适的试验可能是一项艰巨的任务。MatchMiner 有助于弥合这一差距。”
该平台由 Dana-Farber 的 Knowledge Systems Group 开发，由 Ethan Cerami 博士和医学博士、公共卫生硕士 Michael Hassett 领导，借鉴了 Dana-Farber 在基因组分析和临床研究方面的广泛项目。在过去的十年中，该研究所的 40,000 多名患者对他们的肿瘤组织进行了分析，以了解 400 多个癌症相关基因的变化。该研究所及其合作伙伴领导或参与了数千项临床试验，其中包括自 2017 年以来约 450 项涉及靶向治疗的临床试验。2016 年推出的 MatchMiner 将这些系统连接起来，以帮助将患者与适当的试验相匹配。
“肿瘤学家或其他临床医生可以使用 MatchMiner 来查找个体患者的试验选择，”Klein 评论道。“或者，试验团队可以使用它来识别潜在的试验参与者，方法是设置一个基因组过滤器，筛选特定基因组标准的候选人。”
与大多数其他为单个癌症中心设计的匹配平台不同，MatchMiner 是开源的，可以被其他机构采用。随着 Dana-Farber 的新试验开始，策展人会审查它们，以确定它们是否应该包含在 MatchMiner 中，以确保平台是最新的。截至 2021 年 3 月，354 项精准医学试验被整合到 MatchMiner 中。
在新论文中，研究人员分析了 Dana-Farber 精准医学试验的注册数据，以确定 MatchMiner 是否加快了为肿瘤已进行基因组分析的患者寻找合适试验的过程。研究人员发现了 166 个实例，其中平台确定了患者与试验之间的潜在匹配，并且试验团队或患者的肿瘤科医生查看了匹配，从而导致患者同意加入试验。
为了进一步评估该平台的影响，研究人员比较了通过 MatchMiner 获得的 166 份同意书和未经 MatchMiner 获得的 353 份同意书的“同意时间”——肿瘤的基因分析和患者同意参加试验之间的时间。该平台。“我们发现 MatchMiner 组的同意时间比非 MatchMiner 组快 55 天，提高了 22%，”Klein 说。
MatchMiner 不仅通过患者肿瘤的分子特征，还通过患者年龄和肿瘤类型将患者与试验联系起来。其他试验标准，如肿瘤分期、既往治疗和患者的整体健康状况，不考虑用于患者-试验匹配。因此，研究人员说，MatchMiner 提出的匹配是初步的，需要跟进以确保患者符合所有试验标准。
“MatchMiner 为肿瘤已确定基因改变的患者寻找合适的试验提供了一个起点，”Mazor 说。她补充说，该平台的设计者将努力扩展其功能以进行更全面的匹配。通过与医学博士、公共卫生硕士 Kenneth Kehl 的合作，MatchMiner 正在测试基于 AI 的预测，以更好地识别可能很快需要新治疗选择(如临床试验)的患者。
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