导读 基因和它们之间的调控关系创造了决定细胞分化轨迹的复杂网络。然而，我们仍然无法以自下而上的方式使用网络拓扑来理解和预测细胞命运决定过
基因和它们之间的调控关系创造了决定细胞分化轨迹的复杂网络。然而，我们仍然无法以自下而上的方式使用网络拓扑来理解和预测细胞命运决定过程。
近日，中国科学院深圳先进技术研究院傅雄飞教授课题组揭示了细胞生长速率这一全局调控因子如何重塑细胞命运决定格局.
该研究于 3 月 23 日发表在Nature Chemical Biology上。
研究人员利用经典的合成遗传电路，拨动开关，作为玩具模型来研究细胞生长速率对细胞表型状态的影响程度。他们发现基因表达对生长速率变化的反应是不平衡的，导致了肘节的可用表型状态之间的生长速率依赖性相变。
他们还分析了肘节在各种生长条件下的双稳态，揭示了稳态在细胞生长速率的临界值处分叉。他们量化了不同生长速率下的基因表达能力，并提出了一个数学模型来阐明基因表达与生长速率之间的不平衡关系所产生的分叉。
“为了进一步验证模型的能力，我们构建了具有调整的内在参数的开关，并成功预测了它们的稳态特性，”该研究的通讯作者傅教授说。
这种全球监管机制不依赖于特定的监管因素。它普遍存在于细胞命运决定网络中的任何基因中，并且可以出现或编程具有时空顺序的新基因表达模式。
傅教授说：“很难从细胞命运决定过程中分离出诸如生长速度之类的全局因素，”他指出，随着命运决定的结果，生长速度可能会发生变化。“这是先有鸡还是先有蛋的决定。”
然而，借助定量合成生物学，研究人员可以重建隔离宿主遗传网络的正交网络。通过这种方式，他们可以评估生长速率如何影响基因表达以及它们如何促进细胞表型状态的分叉。
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